ОнкоАтлас совместно с ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России проводит
Основные цели школы — внедрение технологии секвенирования в работу лаборатории, обучение основам анализа и интерпретации данных, полученных при NGS секвенировании ДНК пациентов с различными опухолевыми заболеваниями.
Основные цели школы — внедрение технологии секвенирования в работу лаборатории, обучение основам анализа и интерпретации данных, полученных при NGS секвенировании ДНК пациентов с различными опухолевыми заболеваниями.
где организовано или планируется проведение медико-генетических исследований
заведующим лабораторий
врачам — лабораторным генетикам
лабораторным специалистам
Кому будет полезно
Кому будет полезно
лабораторным специалистам
врачам — лабораторным генетикам
заведующим лабораторий где организовано или планируется проведение медико-генетических исследований
Общие принципы интерпретации данных
3
Поиск артефактов секвенирования и пр.
—
Определение соматических и наследственных вариантов
—
Критерии качества данных секвенирования
—
Биоинформатический анализ
2
Основы пробоподготовки и приготовления библиотек
1
Разделы обучающей программы
Основы первичного и повторного медико-генетического консультирования
4
Общие принципы интерпретации данных
3
Поиск артефактов секвенирования и пр.
—
Определение соматических и наследственных вариантов
—
Критерии качества данных секвенирования
—
Биоинформатический анализ
2
Основы пробоподготовки и приготовления библиотек
1
Разделы обучающей программы
Основы первичного и повторного медико-генетического консультирования
4
Орленко Василий Васильевич
Возможности обеспечения пациентов NGS-тестированием за счет программы государственных гарантий и средств региональных фондов ОМС
17:00-18:00
Андгуладзе Игорь Георгиевич
Диагностическая NGS лаборатория: готовые решения для генетического тестирования
16:30-17:00
Иванов Максим Вячеславович
Соло Аves мастер-класс по программному обеспечению для анализа данных NGS
16:00-16:30
Лисица Татьяна Сергеевна
Базовая биоинформатика и результаты секвенирования: что такое данные NGS и как оценить их качество; форматы файлов. Знакомство с базами данных и автоматизированным ПО для анализа данных
15:00-16:00
Строганова Анна Михайловна
Организация NGS-анализа в лаборатории: этапы анализа, зонирование и оснащение лаборатории; сложности при внедрении NGS-анализа
13:40-15:00
Милейко Владислав Айкович
Выбор панели для поиска герминальных и соматических мутаций. Аналитические и диагностические характеристики тест-системы. Внешние и внутренние контроли качества тестирования
13:00-13:40
Перерыв
12:00-13:00
Поспехова Наталья Ивановна
Разбор случаев из реальной практики
11:30-12:00
Филиппова Маргарита Геннадьевна
Практическое первичное медико-генетическое консультирование для определения риска развития ЗНО женской репродуктивной системы и опухолей других локализаций (поджелудочная, предстательная железа)
10:30-11:30
Милейко Владислав Айкович
Клинические задачи, которые можно решить при помощи NGS: биология биомаркеров и биология NGS
10:00-10:30
10 октября
Программа сессии
10:00-10:30
Клинические задачи, которые можно решить при помощи NGS: биология биомаркеров и биология NGS
Милейко Владислав Айкович
10:30-11:30
Практическое первичное медико-генетическое консультирование для определения риска развития ЗНО женской репродуктивной системы и опухолей других локализаций (поджелудочная, предстательная железа)
Филиппова Маргарита Геннадьевна
11:30-12:00
Разбор случаев из реальной практики
Поспехова Наталья Ивановна
12:00-13:00
Перерыв
13:00-13:40
Выбор панели для поиска герминальных и соматических мутаций. Аналитические и диагностические характеристики тест-системы. Внешние и внутренние контроли качества тестирования
Милейко Владислав Айкович
13:40-15:00
Организация NGS-анализа в лаборатории: этапы анализа, зонирование и оснащение лаборатории; сложности при внедрении NGS-анализа
Строганова Анна Михайловна
15:00-16:00
Базовая биоинформатика и результаты секвенирования: что такое данные NGS и как оценить их качество; форматы файлов. Знакомство с базами данных и автоматизированным ПО для анализа данных
Лисица Татьяна Сергеевна
16:00-16:30
Соло Аves мастер-класс по программному обеспечению для анализа данных NGS
Иванов Максим Вячеславович
16:30-17:00
Диагностическая NGS лаборатория: готовые решения для генетического тестирования
Андгуладзе Игорь Георгиевич
17:00-18:00
Возможности обеспечения пациентов NGS-тестированием за счет программы государственных гарантий и средств региональных фондов ОМС
Орленко Василий Васильевич
Подведение итогов
17:30-18:00
Кузнецова Олеся Алексеевна
Филиппова Маргарита Геннадьевна
Разбор результатов с «плохими» заключениями:
как меняется консультация генетика
как меняется консультация онколога
16:30-17:30
Филиппова Маргарита Геннадьевна
Повторное медико-генетическое консультирование по результатам NGS
15:30-16:30
Поспехова Наталья Ивановна
Лисица Татьяна Сергеевна
Практикум по написанию заключений. Практикум по поиску ошибок в заключениях
14:00-15:00
Кузнецова Олеся Алексеевна
Требования клинициста к заключению: что хотят видеть онкологи
15:00-15:30
Перерыв
13:00-14:00
Прокопьев Илья Георгиевич
Требования к написанию заключения по результатам NGS. Примеры из реальной практики лаборатории
12:30-13:00
Иванов Максим Вячеславович
Лисица Татьяна Сергеевна
Практикум по интерпретации результатов NGS (с проверкой на готовых решениях)
11:10-12:30
Поспехова Наталья Ивановна
Общие принципы интерпретации результатов и классификация обнаруженных вариантов.
10:30-11:10
Волгина Надежда Евгеньевна
Решение для организации рабочего процесса молекулярно-генетических методов, основанных на технологии NGS.
10:00-10:30
11 октября
10:00-10:30
Решение для организации рабочего процесса молекулярно-генетических методов, основанных на технологии NGS.
Волгина Надежда Евгеньевна
10:30-11:10
Общие принципы интерпретации результатов и классификация обнаруженных вариантов.
Поспехова Наталья Ивановна
11:10-12:30
Практикум по интерпретации результатов NGS (с проверкой на готовых решениях)
Лисица Татьяна Сергеевна
Иванов Максим Вячеславович
12:30-13:00
Требования к написанию заключения по результатам NGS. Примеры из реальной практики лаборатории
Прокопьев Илья Георгиевич
13:00-14:00
Перерыв
14:00-15:00
Практикум по написанию заключений. Практикум по поиску ошибок в заключениях
Лисица Татьяна Сергеевна
Поспехова Наталья Ивановна
15:00-15:30
Требования клинициста к заключению: что хотят видеть онкологи
Кузнецова Олеся Алексеевна
15:30-16:30
Повторное медико-генетическое консультирование по результатам NGS
Филиппова Маргарита Геннадьевна
16:30-17:30
Разбор результатов с «плохими» заключениями:
как меняется консультация генетика
как меняется консультация онколога
Филиппова Маргарита Геннадьевна
Кузнецова Олеся Алексеевна
17:30-18:00
Подведение итогов
врач-онколог, м.н.с. отделения противоопухолевой лекарственной терапии №2 НМИЦ им. Н.Н.Блохина
Кузнецова Олеся Алексеевна
к.ю.н., доцент, медицинский юрист, основатель и Управляющий партнер юридической компании «Орленко и партнеры»
Орленко Василий Васильевич
руководитель направления NGS и цифровой ПЦР, компания «ДИА-М»
Волгина Надежда Евгеньевна
к.м.н., старший научный сотрудник, врач-генетик научно-консультативного отделения ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина»
Филиппова Маргарита Геннадьевна
к.м.н., заведующая лабораторией молекулярно-генетической диагностики отдела морфологической и молекулярно-генетической диагностики опухолей ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина»
Строганова Анна Михайловна
к.б.н., руководитель Отдела разработки и биоинформатики ООО «ОнкоАтлас»
Иванов Максим Вячеславович
Директор ОнкоАтлас
Милейко Владислав Айкович
Наши спикеры
врач лабораторный генетик молекулярно- биологической лаборатории отдела морфологической и молекулярно-генетической диагностики опухолей ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина»
Лисица Татьяна Сергеевна
д.б.н., с.н.с. лаборатории молекулярно-генетической диагностики ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина»
Поспехова Наталья Ивановна
врач-онколог, м.н.с. отделения противоопухолевой лекарственной терапии №2 НМИЦ им. Н.Н.Блохина
Кузнецова Олеся Алексеевна
к.ю.н., доцент, медицинский юрист, основатель и Управляющий партнер юридической компании «Орленко и партнеры»
Орленко Василий Васильевич
руководитель направления NGS и цифровой ПЦР, компания «ДИА-М»
Волгина Надежда Евгеньевна
к.м.н., старший научный сотрудник, врач-генетик научно-консультативного отделения ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина»
Филиппова Маргарита Геннадьевна
к.м.н., заведующая лабораторией молекулярно-генетической диагностики отдела морфологической и молекулярно-генетической диагностики опухолей ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина»
Строганова Анна Михайловна
к.б.н., руководитель Отдела разработки и биоинформатики ООО «ОнкоАтлас»
Иванов Максим Вячеславович
Директор ОнкоАтлас
Милейко Владислав Айкович
врач лабораторный генетик молекулярно- биологической лаборатории отдела морфологической и молекулярно-генетической диагностики опухолей ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина»
Лисица Татьяна Сергеевна
д.б.н., с.н.с. лаборатории молекулярно-генетической диагностики ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина»
Поспехова Наталья Ивановна
Спонсоры
Видеозаписи прошедших выступлений
https://www.youtube.com/watch?v=Q-DPT3QgmBI; Мультиплексирование, расчет загрузки запуска, всё об индексах; 22:37; Татьяна Григорьева, к.м.н., главный исследователь Отдела исследований и биоинформатики «ОнкоАтлас».
https://www.youtube.com/watch?v=IB3ceJndvvY; Что в черном ящике? Аналитические и диагностические характеристики тест-системы.; 22:02; Максим Иванов, к.б.н., руководитель Отдела исследований и биоинформатики «ОнкоАтлас».
https://www.youtube.com/watch?v=uYVgox7M2s4; «Мокрая» часть: основные возможные причины неуспеха исследований; 22:25; Олег Машков, к.м.н., заведующий молекулярно-генетической лабораторией ГБУЗ РМНЦ.
https://www.youtube.com/watch?v=kqiIW0eJpG4; Результаты секвенирования: форматы файлов, оценка «сырых» данных; 22:46; Валентина Якушина, к.м.н., главный исследователь Отдела исследований и биоинформатики «ОнкоАтлас».
https://www.youtube.com/watch?v=UPmZJWsDfJM; Сценарии выравнивания и препроцессинга, особенности технологий; 15:10; Валентина Якушина, к.м.н., главный исследователь Отдела исследований и биоинформатики «ОнкоАтлас».
https://www.youtube.com/watch?v=yswk87ufsKw; Поиск вариантов: этап коллинга, артефакты, принципы фильтрации; 13:17; Валентина Якушина, к.м.н., главный исследователь Отдела исследований и биоинформатики «ОнкоАтлас».
https://www.youtube.com/watch?v=qvwLTZus5KY; За пределами стандартного пайплайна; 22:57; Максим Иванов, к.б.н., руководитель Отдела исследований и биоинформатики «ОнкоАтлас».
https://www.youtube.com/watch?v=qna-1PwITZU; Общие принципы интерпретации результатов и формирования отчета; 22:11; Максим Иванов, к.б.н., руководитель Отдела исследований и биоинформатики «ОнкоАтлас».